新冠肺炎疫情发生以来，全国同胞同舟共济，举国上下同心抗“疫”，新疆乌鲁木齐基督教会按照国家疫情防控工作决策部署，以及基督教全国两会《关于各堂点疫情防控和安全保障工作的通知》精神，对疫情影响下全市教会的聚会提早作出安排，及时作出调整，积极投身到全国防控战“疫”中。

2020年1月24日，乌鲁木齐市基督教协会在微信公众号平台上发出“抗击疫情 人人有责”的通知，邀请全市教会众弟兄姊妹在除夕之夜居家守望祈祷，并通知减少外出，春节当天发布暂停礼拜通知。

1月31日，在一对基督徒夫妇的援助中，乌鲁木齐市基督教协会与明德堂同工将7000只口罩，分别捐助市内的两个社区，解决社区居民和一线工作人员缺乏口罩的燃眉之急。市基督教协会牧者还分别到乌鲁木齐市多间教会，给留守值班人员送去口罩，带去安慰和鼓励，嘱托各教会严格落实抗疫防控的各项措施。乌鲁木齐市基督教协会向乌鲁木齐市红十字会捐款5万元，明德堂向天山区红十字会捐款3万元，米东区的教会堂点向本区红十字会捐款2.15万元，沙依巴克区的教会堂点为社区抗疫第一线捐款1.6万元，达坂城区的两间聚会点在本区内捐款2万元，教会牧者个人捐款2000元，特为“爱德驰援共抗新冠疫情”筹款捐助6.55万元。

教会许多弟兄姊姊也在所属单位积极捐款，在疫情中尽基督徒的社会责任。截止1月12日，乌鲁木齐市教会共捐赠口罩7000只，捐款20.5万元。目前捐款活动还在继续中。