经过近两年的学习，金陵协和神学院首批博士研究生已经修毕相关课程，成绩合格，并通过外语考试和专业课程综合考试，于2018年5月4日通过论文开题报告，顺利成为博士候选人。根据《金陵协和神学院攻读神学博士学位研究生培养工作规定》，2020年学院将有首批神学博士研究生毕业。

在国家宗教事务局和基督教全国两会的领导与支持下，金陵协和神学院于2016年参照国内普通高校以及国际上神学院校博士研究生培养工作的相关经验，结合我国宗教院校的相关规定，同时根据学院的实际情况，完成了系统神学专业博士研究生课程的设置，并于2016年9月顺利招入新生。此乃中国教会自办的第一个博士课程。